導讀:癌症相關成纖維細胞(CAFs)是腫瘤微環境(TME)的主要組成部分,影響癌症的特征,但目前尚未有係統的研究來揭示它們在不同癌症中普遍存在的特征。最近,有研究團隊在單細胞分辨率下對癌症中CAFs及其亞型進行了係統研究,強調了CAFs在癌症生物學中潛在的異質性和可塑性。
2022年11月4日,四川大學華西醫院羅晗、許恒團隊與韓國光州科學技術學院Jihwan Park團隊在Nature Communications上聯合發表了題為“Pan-cancer single-cell analysis reveals the heterogeneity and plasticity of cancer-associated fibroblasts in the tumor microenvironment”的研究論文。該研究對10種實體癌的226個樣本進行泛癌分析,以單細胞分辨率分析TME,揭示了異質性 CAFs 的共性/可塑性。
研究背景
與惡性細胞一樣,異質性腫瘤微環境(TME)複合材料也是腫瘤的重要組成部分。它們與惡性細胞相互作用,形成癌症的特征。TME中存在不同類型的非惡性細胞,主要包括成纖維細胞、免疫細胞(如骨髓細胞、淋巴細胞和巨噬細胞)和內皮細胞。先前的研究強調了TME在癌症的生物學能力中不可或缺的作用,如腫瘤進展、治療耐藥性、血管生成誘導和轉移。
在所有類型的基質細胞中,成纖維細胞是TME的主要成分,而癌症相關成纖維細胞(CAFs)在癌症中發揮著顯著的腫瘤支持作用。除了直接與惡性上皮細胞相互作用外,CAFs還能產生“腫瘤許可型”TME,包括誘導正常成纖維細胞激活為CAFs、促進內皮細胞血管生成、招募髓樣細胞以及免疫抑製T細胞。因此,CAFs通過與其他TME成分相互作用在塑造TME中發揮關鍵作用,顯示出了其作為預後因子和治療靶點的潛在價值。最近的研究已經明確了CAFs的各種亞型,但CAFs的確切起源仍有爭議,其缺乏普遍的表征阻礙了臨床實踐中的CAFs靶向治療。
近年來,單細胞RNA測序(scRNA-seq)技術的發展為研究細胞狀態波動和細胞可塑性強度提供了機會。癌細胞和 TME 的特征已在多種類型的癌症中進行了分析,揭示了單細胞分辨率下不同組分癌症樣本的異質性。最近還有一些基於scRNA-seq的泛癌症研究,在可控偏倚下分析細胞數量,展示了TME細胞的普遍特征。然而,這些泛癌研究隻關注免疫細胞的特性,忽略了不同細胞成分之間的相互作用。
研究概述
為了分析實體癌的TME景觀,研究人員編譯了10種常見實體癌類型的單細胞轉錄圖譜。經過嚴格的質量控製和過濾,共納入了來自226個樣品的855,271個細胞,無監督聚類共產生34個TME相關簇。根據不同細胞類型的典型標誌物,這些簇被分為5種主要細胞成分,包括成纖維細胞,淋巴細胞,髓係細胞,內皮細胞和漿細胞。
通過基於CellphoneDB的分析,研究人員發現,在TME中,成纖維細胞、內皮細胞和髓係細胞之間的串擾占主導地位,而在腫瘤/鄰近樣本中,無論組織類型如何,成纖維細胞與其他TME成分的相互作用最為頻繁。這表明成纖維細胞在癌症生物學中可能通過與其他TME成分的交流發揮重要作用。
研究團隊將所有癌症類型的CAFs彙集在一起,以探索CAFs可能的激活過程。進化軌跡顯示,主要的CAFs來源於NFs(正常組織),並演化為不同的分化狀態,這些狀態可能對TME產生不同的影響。主要的CAF類型的激活軌跡分為三種狀態,表現出與其他細胞成分的不同相互作用,並與免疫治療的預後有關。
此外,小部分的CAF成分代表了其他TME成分(如內皮細胞和巨噬細胞)的替代來源。尤其是,廣泛存在的內皮-間充質轉變CAF,可能與近端SPP1+腫瘤相關的巨噬細胞相互作用,與內皮-間充質轉變和生存分層有關。
研究總結
總之,這項研究係統地描述了各種癌症中CAFs的特征,不僅提供了CAFs的可能起源,而且強調了CAFs在免疫治療結果和預後中的不同狀態。雖然需要進一步的實驗驗證來確定每個CAF簇的功能作用和CAFs的不同起源,但研究人員表示,對CAFs的泛癌症研究可能會促進未來CAFs靶向治療的發展和應用。
參考資料:
https://doi.org/10.1038/s41467-022-34395-2