ATS於1988年曾發布過成人肺部真菌感染指南，但主要針對HIV免疫功能缺陷人群。在過去10年間，肺部真菌感染病例數顯著增加，診斷方法和技術不斷發展，並出現了大批新型抗真菌藥物，因此，ATS組織真菌感染領域專家，針對目前成人及重症患者肺部真菌感染的治療，製定了本指南，於2011年1月1日發表於《美國呼吸與重症醫學雜誌》（Am J Respir Crit Care Med）。

　　本指南通過循證醫學（包括已發表的雜誌文章、指南及Medline和Pubmed中的電子數據等）顯示每個證據的重要性，主要關注三個方麵內容，① 地方性真菌病，包括組織胞漿菌病、孢子絲菌病、芽生菌病及球孢子菌病；② 免疫缺陷及重症病人的真菌感染，包括隱球菌病、曲黴菌病、念珠菌病及肺孢子菌肺炎；③ 罕見的和新出現的真菌感染。

　　指南介紹了目前常用的抗真菌藥物，包括多烯類（兩性黴素B以及其衍生物）、三唑類（氟康唑、伊曲康唑、伏立康唑、普沙康唑等）及棘白菌素類（卡泊芬淨、麥卡芬淨、阿尼芬淨等），並對組織胞漿菌病、孢子絲菌病、芽生菌病、球孢子菌病、副球孢子菌病、隱球菌病、曲黴菌病、念珠菌病及肺孢子菌肺炎的治療提出指導性意見，對其他如接合菌、鐮刀菌、尖端賽多孢菌、暗色絲孢黴及毛孢子菌等也提出了具體的治療意見。