用於哮喘microRNA生物標誌物鑒定的基因網絡分析

作者:高與遙 孔靈菲 來源:哮喘聯盟 日期:23-02-15

摘要

背景:迄今為止,哮喘的可靠生物標誌物還沒有被發現。MicroRNAs (miRNAs)是一種小的非編碼RNA,可負向調節轉錄後基因表達,它們與包括哮喘在內的多種疾病有關。MiRNAs可以作為理想的生物標誌物,因為它們能夠調節多種途徑。本研究旨在識別哮喘的miRNA生物標誌物特征。

方法:采用屋塵蟎(HDM)小鼠過敏性炎症模型。通過評估肺功能、過敏反應、氣道炎症和重塑對小鼠進行表型分析。通過小RNA測序確定血清和肺組織中的miRNA特征譜,並使用Qiagen CLC Genomics Workbench對數據進行分析。為了確定相關的基因靶點,我們進行了mRNA測序,然後進行mirna -靶點分析。這些miRNAs和靶標有待於後續的通路和功能分析。

結果:HDM暴露的小鼠出現了過敏性哮喘的表型特征。miRNA測序分析顯示,與對照組小鼠相比,213個miRNAs在HDM小鼠肺中顯著失調(FDR p-值< 0.05和倍數變化表達> + 1.5和< - 1.5)。相反,隻有一個miRNA (miR-146b-5p)在血清中顯著升高。肺調節異常miRNAs的靶分析顯示,共131個miRNAs作用於211個mRNAs。通路分析顯示,Th2/Th1是與miRNAs失調相關的最顯著激活的信號通路。富集度最高的疾病是炎症反應和疾病,其中包括哮喘。哮喘網絡分析表明,131個miRNAs中有113個與哮喘發病機製直接相關。

結論:這些發現表明,HDM模型中大多數失調的miRNAs通過Th2信號通路與哮喘發病機製相關。我們確定了一組30種miRNAs作為哮喘的潛在候選生物標誌物。

文獻來源:Paulene Cay et al. Gene network analysis for identification of microRNA biomarkers for asthma. Respir Res. 2022 Dec 26. ID: 36572876

關鍵字:哮喘,microRNA生物標誌物

分享到:
新浪微博 微信 騰訊微博 更多
更多評論
//站內統計//百度統計//穀歌統計//站長統計