外用藥物療法是目前治療生殖器疣較常用的方法之一。它是通過藥物的化學性破壞作用來破壞HPV（人類乳頭瘤病毒）感染的疣體組織，從而達到消除生殖器疣的目的。另外，有些化學藥物同時還具有抗HPV作用、抗增生作用和免疫調節作用。現將臨床上常用的生殖器疣外用藥特點分列如下，以方便患者合理選用。　　

　　三氯醋酸：這是一種化學性破壞劑，對生殖器疣具有化學性凝固作用，能使尖銳濕疣萎縮，加之三氯醋酸對角質剝脫溶解的協同作用，最終使疣體脫落。此藥治療生殖器疣的療效較好，一次性治愈率較高，但治療後生殖器疣的複發率也較高，且常在去除生殖器疣後很快複發。該藥的局部不良反應是在塗藥時會發生輕度到中度刺痛。藥物濃度太高、用藥量太大或用藥次數過多時可引起局部紅腫、潰瘍，並形成疤痕。由於三氯醋酸不被皮膚黏膜吸收，故該藥是唯一可用於治療孕婦生殖器疣的外用藥物。　

　　冰醋酸：也是一種化學性破壞劑，其作用機理、用藥方法、療效以及不良反應也與三氯醋酸相同。若將冰醋酸藥液誤塗於正常皮膚黏膜時，應立即用生理鹽水衝洗，以免造成嚴重燒傷。　

　　足葉草毒素：又稱“鬼臼樹脂”，是一種從足葉草脂中精煉的提取物。用藥方法是每日兩次，3天為一療程。停藥待疣體脫落後，視情況再決定是否繼續用藥。若疣體未完全消退則需要重複一個療程，但每個療程間隔時間應在4～6天以上。　

　　5－氟尿嘧啶（5－FU）：是一種細胞增生抑製劑，對HPV複製有抑製作用。該藥能抑製細胞內胸苷酸的生成，並通過幹擾DNA和RNA的合成來抑製細胞生長，進一步導致細胞損傷或凋亡。近年來，5－FU被廣泛用於治療生殖器疣。該藥的特點是經濟、療效好、使用方便。　

　　安達芬乳膏：化學名為重組人幹擾素α－2b乳膏，該藥對局部皮膚具有抗病毒、提高免疫功能、增強巨噬細胞吞噬功能、增強細胞毒T細胞的殺傷作用等功效。值得注意的是在塗抹本品的患病部位禁止合用其他外用藥物。　

　　咪喹莫特（imiquimod）：是一種新型的外用免疫調節劑。研究表明，咪喹莫特及其他咪唑喹啉胺類藥物均具有抗病毒和抗腫瘤能力，這種抗病毒和抗腫瘤能力並不是直接的，而是通過誘導機體產生一些細胞因子而發揮作用。皮損治愈平均時間為6～10周，最短為4周，複發率為13％～19％。不良反應主要表現為局部的瘙癢、燒灼感、刺激、疼痛和觸痛等。