研究顯示，甲型H1N1流感病毒目前對神經氨酸酶抑製劑奧司他韋（oseltamivir）、紮那米韋（zanamivir）敏感，對金剛烷胺和金剛乙胺耐藥。
對於臨床症狀較輕且無合並症、病情趨於自限的甲型H1N1流感病例，無需積極應用神經氨酸酶抑製劑。
對於發病時即病情嚴重、發病後病情呈動態惡化的病例，感染甲型H1N1流感的高危人群應及時給予神經氨酸酶抑製劑進行抗病毒治療。開始給藥時間應盡可能在發病48小時以內（以36小時內為最佳）。對於較易成為重症病例的高危人群，一旦出現流感樣症狀，不一定等待病毒核酸檢測結果，即可開始抗病毒治療。孕婦在出現流感樣症狀之後，宜盡早給予神經氨酸酶抑製劑治療。
奧司他韋：成人用量為75mg b.i.d.，療程為5天。對於危重或重症病例，奧司他韋劑量可酌情加至150mg b.i.d.。對於病情遷延病例，可適當延長用藥時間。1歲及以上年齡的兒童患者應根據體重給藥：體重不足15kg者，予30mg b.i.d.；體重15-23kg者，予45mg b.i.d.；體重23-40kg者，予60mg b.i.d.；體重大於40kg者，予75mg b.i.d.。對於吞咽膠囊有困難的兒童，可選用奧司他韋混懸液。
紮那米韋：用於成人及7歲以上兒童。成人用量為10mg吸入 b.i.d.，療程為5天。7歲及以上兒童用法同成人。
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