卵巢癌是一種致命的疾病,是出了名的難診斷治療的癌症。加州大學聖地亞哥醫學院以及Moores癌症中心科學家鑒定出了卵巢癌細胞的6個mRNA亞基(信使RNA),使早期卵巢癌的診斷成為可能。更重要的是,在這些mRNA亞基中,有些能編碼針對新療法的特殊蛋白質。這項研究成果5月25日發表在Proceedings of the National Academy of Sciences上。
“過去很多研究旨在利用DNA檢測癌症”,該研究的第一作者(加州大學聖地亞哥遺傳組醫學院信息生物學專家以及項目科學家) Christian Barrett博士說,“我們很好奇,如果我們開發一種基於腫瘤特異性mRNA的卵巢癌檢測方法來代替DNA檢測的方法,會是怎樣的結果?這種腫瘤特異性mRNA從腫瘤細胞擴散到子宮頸,且可以通過常規的巴氏試驗收集”。
DNA與mRNA有什麼聯係和區別呢?DNA攜帶了生命所必須的所有指令,它包含的不僅僅是編譯蛋白質的序列,還包含其他序列。而mRNA是DNA的互補序列,攜帶了蛋白質的所有信息。細胞核的DNA把遺傳物質傳遞給mRNA,由mRNA轉移到細胞質,在細胞質中各種細胞器可以識別mRNA中的信息,同時合成蛋白質。作者表明,利用腫瘤mRNA來診斷癌症優於DNA檢測癌症的理由如下:一個癌症細胞可能隻有一個或幾個拷貝的DNA突變區,但可能有數百到數千拷貝的mRNA突變區。
此圖為蛋白質合成示意圖
為了確定是否可以通過mRNA從正常細胞中區分出卵巢癌細胞,研究人員開發了一個特定的生物信息學算法,並利用這個算法來挖掘兩個公共遺傳信息數據庫——癌症基因圖譜(TCGA)和基因組織表達程序(GTEx),這兩個數據庫都是由美國國立衛生研究所發起。TCGA編目了500個腫瘤的DNA和RNA,涵蓋了許多種癌症類型,而GTEx是正常組織樣本的DNA和RNA的數據庫。基於此,研究人員可以分析295個卵巢腫瘤以及1839個正常組織樣本的mRNA序列。
利用生物信息學的方法,研究人員確定了6種mRNA亞基分子,這些腫瘤特異性mRNA亞基的鑒定,對卵巢癌的早期診斷治療有很大的幫助。同時他們用定量RT-PCR來驗證其研究結果,用該技術來檢測實驗室培養的細胞中的卵巢癌mRNA分子。
除了在診斷方麵的潛力,本研究中發現的mRNA亞基分子中,有些還可以作為新的治療靶點。科學家預測這些mRNA亞基可以翻譯一些含有特殊氨基酸的蛋白質,這可使之成為一些特殊療法的靶點,比如單克隆抗體、基於T細胞的疫苗等。更重要的是,卵巢癌特異性mRNA亞基本身就可以作為新的治療靶點。
“我們是在實驗室裏研究一係列卵巢癌細胞得出的該結果,我們需要進行臨床試驗才能確定患有卵巢癌的婦女身上含有這種mRNA亞基分子,而未患卵巢癌的婦女身上沒有這種mRNA亞基分子。”本研究的共同作者Cheryl Saenz醫學博士(專門從事婦科癌症治療的生殖醫學臨床專家)說。
本研究的作者承認他們的方法存在一些不足之處,其中包括mRNA亞基分子檢測技術的不足,缺乏正常卵巢與輸卵管的對照樣本,腫瘤細胞向子宮頸擴散後基因表達可能與原始腫瘤不同。
不過,基於這些可喜的初步結果,作者建議將他們識別腫瘤特異性mRNA亞基的方法擴大到研究其他30個已知足夠多RNA序列的癌症類型中。這6種mRNA亞型的發現將會有效的幫助廣大女性進行早期的卵巢癌排查和診斷。同時也給卵巢癌治療帶來了新的方案。
延伸閱讀:mRNA在其他癌症診斷領域的應用
1.mRNA診斷早期肝癌
mRNA診斷早期肝癌的研究也取得了進展。日本鳥取大學三島典正先生和汐田剛史先生早些年成功開發了檢測血清中hTERT的mRNA的高靈敏度定量方法,hTERT是和癌的發生、進展有關的端粒酶的催化單位。他們在對多個醫療機構的臨床樣品血清中的hTERT的mRNA進行評估的過程中,發現在肝細胞癌的診斷上該方法的靈敏度和特異性均優於其他腫瘤標記物,該成果發表在日本肝髒學會總會上。
2. mRNA診斷早期宮頸癌
人半翼基因(hWAPL)是宮頸癌特異性高表達基因,檢測hWAPL基因mRNA表達水平對宮頸癌早期診斷有重要的意義。幾年前鄭州大學第二附屬醫院婦產科研究人員使用高危型人乳頭瘤病毒(HPV)檢測試劑盒以及熒光定量PCR檢測100例慢性宮頸炎、宮頸上皮肉瘤樣變(CIN)和宮頸瘤患者的hWAPL基因mRNA和高危型HPV。結果顯示高危型HPV檢出率與宮頸癌發生密切相關,hWAPL基因mRNA表達與宮頸癌變直接相關,這有助於宮頸癌的早期診斷。該研究結果於2007年發布在《國外醫學婦產科學分冊》上。
3.mRNA診斷膀胱癌
用RT-PCR檢測尿液中survivin基因(該基因作為腫瘤診斷、判斷預後和治療的靶點)的mRNA,在國內外相關研究較多。與病理檢查相比,mRNA診斷膀胱癌有較高的敏感度和特異度,可作為膀胱鏡檢查的主要輔助手段之一,用於膀胱癌的篩查及術後監測。
4.mRNA診斷直腸癌區域淋巴結微轉移
準確判斷新區域淋巴結有無腫瘤細胞早期轉移,對其臨床診斷、治療及預後判斷具有十分重要的意義。北京大學深圳醫院的研究人員通過病理組織學及RT-PCR擴增K19 mRNA,對19例直腸癌患者的癌組織標本和51個淋巴結進行檢測,結果表明19例直腸癌患者癌組織均有K19mRNA表達,51個淋巴結中組織學陽性16個(31.4%),而RT-PCR陽性21個(41.2%)。從而研究人員認為mRNA檢測直腸癌區域淋巴結為轉移是一種靈敏、特異的檢測方法,優於常規病理組織學方法。該研究結果於2008年發表在Modern Oncology上。
5.mRNA診斷胃癌淋巴結微轉移
研究胃癌微轉移,有助於對惡性腫瘤進行更加全麵的認識和更加合理的分期,為治療提供幫助。應用時熒光定量PCR的方法定量檢測胃癌淋巴結CK18mRNA的表達水平,結果發現胃良性病變淋巴結CK18mRNA表達全部為陰性,而胃癌組織CK18mRNA表達全部為陽性,說明CK18mRNA的表達可作為胃癌淋巴結微轉移的標誌。該研究結果在2009年《全國臨床免疫檢驗研討會暨第六屆全國臨床免疫學術會議論文彙編》中有報道。
小結
癌症早期診斷是一種專門針對癌症早期患者的診療方法,其目的在於早發現早治療,從而減輕患者痛苦和精神、經濟負擔。爭取通過癌症早期診斷治療讓癌症患者早日康複。基於mRNA分析診斷的發展將是分子醫學領域的一場革命,它不僅提供了一種新的檢測方法,並且具有高靈敏度、高特異性等特點。