隨著農村人口到城市的大規模內部遷移，給中國的結核病控製 帶來了新的挑戰。現有研究人員結合基因組、空間和流行病學數據，對結核病在有大量流動人口的城市環境中的動態進行調查。

研究人員在上海鬆江進行一以人群為基礎的研究。利用全基因組測序區分有相同的可變數字串聯重複(VNTR)模式的M結核分枝杆菌的表觀遺傳群，並分析居住的鄰近性與基因組聚集的M型結核杆菌的風險之間的關係。最後，利用基因組、空間和流行病學數據估計結核在流動人口和居民之間的感染時間和傳播關係。

2009年1月1日-2015年12月31日，共記錄了1620例結核杆菌培養陽性樣本，其中1211(75%)例來源於內部流動人口。在具有相同VNTR模式的218人中，有150(69%)人在10個單核苷酸多態性(SNPs)中至少分離出一種菌株，與近期傳播的M結核杆菌一致。與生活相距較遠的個體相比，從生活相距較近的個體中收集到的菌株基因更可能相似——患者距離每增加一千米，菌株在10個SNPs內基因型匹配的概率大約降低10%(OR 0.89[95% CI 0.87-0.91];p<0.0001)。因此，研究人員推斷結核從常住人口傳播給流動人口和從流動人口傳播給常住人口一樣普遍，此外，研究人員還估計基因簇中超過三分之二的流動人口是在遷移後的居住地感染結核。

在城市中心地區，導致當地結核發病率的主要機製是流動人口和常住居民之間的局部傳播。結核流行病學、基因組和空間數據分析，可更好的理解局部傳播動態，應適當予以更有效的幹預措施。

原始出處：

Chongguang Yang，et al.Internal migration and transmission dynamics of tuberculosis in Shanghai， China： an epidemiological， spatial， genomic analysis.The Lancet Infectious Diseases. April 19，2018.https：//doi.org/10.1016/S1473-3099(18)30218-4