世界衛生組織在2020年3月宣布了COVID-19的全球大流行，是21世紀的第二次大流行。嚴重急性呼吸綜合征冠狀病毒2 (SARS-CoV-2)是冠狀病毒科的一種RNA beta冠狀病毒。病毒種群的擴大，如SARS-CoV-2，積累了許多共享的多態性，使傳統的聚類方法產生了混淆。在這種情況下，降低SARS-CoV-2種群占用的序列空間複雜性的方法對於準確的集群分群是必要的。

近日來自巴西烏貝蘭迪亞聯邦大學、維索薩聯邦大學和巴西利亞大學的研究人員通過關注廣泛共享的非結構順反子(nsp3、nsp4、nsp6、nsp12、nsp13和nsp14)、結構基因(刺突蛋白和核衣殼)和附屬基因(ORF8)的多態性，提出了將全球SARS-CoV-2群體細分為16個定義明確的亞型，相關研究成果於近日發布在預印本平台bioRxiv上，文章題目為"The global population of SARS-CoV-2 is composed of six major subtypes"。

研究人員發現，在患者人群中占主導地位的是六種病毒亞型，但所有16種亞型的病毒都表現出可能具有表型意義的氨基酸替代情況。研究人員推測在這項研究中檢測到的病毒亞型是SARS-CoV-2多樣化早期階段的記錄，這些病毒被隨機取樣以組成世界各地的病毒種群，這是典型的創始人效應。

研究人員表示，SARS-CoV-2感染者確定的病毒的遺傳結構為最大限度地提高候選疫苗或藥物試驗的有效性提供了實質性的指導。