基因組分析對COVID-19臨床試驗具有重要意義

作者:佚名 來源:生物探索 日期:20-04-08

        英國布裏斯托大學的科學家對新冠病毒SARS-CoV-2的遺傳物質進行測序,以查明該病毒如何指示細胞製造病毒蛋白,該蛋白既可以用來形成病毒顆粒,也可以減緩免疫反應,這對全世界進行疫苗試驗的科研人員都具有重要意義。研究結果發表在預印本網站bioRxiv上。

        在本文中,研究人員在實驗室中繁殖了活的人類SARS-CoV-2病毒,使用Oxford Nanopore MinION進行直接RNA測序,確定了生長在猴子Vero E6細胞中病毒的轉錄組特征並使用最近開發的以ORF為中心的管道分析。當該病毒在猴子細胞中生長時,它可以對病毒表麵上發現的蛋白質做出重大改變,這種蛋白質被稱為“刺突糖蛋白”,可促進其進入宿主細胞,並且是免疫係統對抗病毒的重要靶標。他們還描述了病毒製造的許多蛋白質的一種重要修飾,稱為磷酸化,可以改變病毒蛋白質的功能,並可能為治療病毒的藥物提供線索。有些藥物就是通過改變蛋白質的磷酸化模式用於治療疾病,它們理論上也可能改變感染者病毒蛋白的磷酸化模式並幹擾病毒複製。

        三聚體形式的野生型SARS-CoV-2刺突糖蛋白的空間填充模型,分別使用天然和刺突缺失病毒的序列

        重要的是,這些發現對進行疫苗研究以及正在尋找合成抗體來治療感染的科學家具有重要意義,因為當病毒在實驗室中大規模生長時,可能會改變刺突糖蛋白,當這種突變的病毒被用於重要的動物臨床試驗時,可能使人們更難或無法了解疫苗或合成抗體是否有效,所以從事疫苗和藥物測試的團隊需要格外小心,以確保病毒在實驗室生長時不會發生變化。

關鍵字:COVID-19

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