據衛生部網站10月10日的通報，2011年9月（2011年9月1日零時至9月30日24時）全國（不含台港澳，下同）報告法定傳染病546932例，死亡1390人。

甲類傳染病報告鼠疫1例，已死亡；報告霍亂發病7例，無死亡。

乙類傳染病除傳染性非典型肺炎、人感染高致病性禽流感和白喉無發病、死亡病例報告外，其餘23種傳染病共報告發病317564例，死亡1353人；報告發病數居前五位的病種依次為病毒性肝炎、肺結核、梅毒、細菌性和阿米巴性痢疾、淋病，占乙類傳染病報告發病總數的96%。

丙類傳染病報告發病229360例，死亡36人。

　　報告發病數居前三位的病種依次為手足口病、其他感染性腹瀉病和流行性腮腺炎，占丙類傳染病報告發病總數的95％。