轉錄因子網絡塑造了基因表達過程,並且負責正常的細胞身份和致病狀態。
最近,有研究人員使用核心調控環路分析(CRC)鑒定了腎細胞癌(RCC)細胞中的一個候選致癌基因PAX8。大規模功能基因組驗證篩選確定了PAX8的功能沉默能夠導致RCC細胞係增殖減弱。PAX8依賴的順反組表觀遺傳分析闡釋了PAX8具有活性增強子元件,並控製各種代謝相關途徑基因的表達。研究人員選擇了鐵氧化酶血漿銅藍蛋白(CP)作為模範基因來解析PAX8的分子功能。研究發現,PAX8能夠在CP啟動子的增強子結合環路上招募組蛋白乙酰化活性。重要的是,CP的表達與PAX8沉默敏感性有關,並鑒定了具有不良生存的RCC案例亞群。
最後,研究人員指出,他們的數據鑒定了PAX8是RCC的一個候選致癌基因,並提供了控製活性的潛在生物標記。