近期來自香港大學李嘉誠醫學院和輝瑞製藥公司等機構的研究人員利用先進的基因組技術,揭示了胃癌的所有基因突變,並發現了20個胃癌驅動基因,並證實一種名為ARID1A的腫瘤驅動基因在某種類型的胃癌中突變率高達70%-80%。相關研究成果發表在最新一期(12月)的《自然——遺傳學》(Nature Genetics)雜誌上。
領導這一研究的是來自香港大學李嘉誠醫學院病理學係臨床教授梁雪兒以及輝瑞公司徐江春博士。
胃癌是人類健康的最大威脅,全球腫瘤中8%的發病率和10%的死亡率由其引起。早期胃癌無明顯症狀,大多數患者就診時已到中晚期,沒有有效治療方法。胃癌是由基因突變引發,因幽門螺旋杆菌感染、進食過多醃肉及泡菜等醃製食品、或吸煙、令致癌物於胃部形成,破壞DNA而導致,在老年人中發病率尤其高。
人類基因組含有超過3萬個基因,由30億個基因密碼組成,在這浩如煙海的基因組中,要逐一去尋找導致胃癌的基因突變有如大海撈針,不僅困難而且進度緩慢。所以,過去數十年來,隻有大約十幾個胃癌相關基因變異被發現和證實。絕大多數致癌的基因突變發生於外顯子區域,這一區域約占整個基因組的2%,是負責製造蛋白質這一人體的重要組件。近年來,DNA測序技術突飛猛進,利用外顯子測序技術選擇性地捕獲所有外顯子區域DNA作新一代DNA測序,可在兩周內完成一個胃癌組織所有基因外顯子的測序,找出當中的所有突變基因。
為了尋找新的胃癌治療方法,確定胃癌的致癌基因突變,研究人員對來自22名香港胃癌患者的腫瘤組織和相應的瘤旁正常組織的16萬個基因外顯子進行了測序,一網打盡了所有的癌基因突變。研究人員發現每個胃癌患者平均約有62個導致蛋白序列改變的基因突變,最高的可以有過千。有的基因突變,雖發生在很少數胃癌患者身上,但現已有靶標藥物於臨床試驗階段,有助於發展個體化治療。
研究小組還發現,有些突變的基因在多個胃癌患者的腫瘤組織中頻繁出現,可能對腫瘤發展至關重要,被稱為腫瘤驅動基因。研究小組發現了20個胃癌驅動基因,許多是前所未知的。其中,一個名為ARID1A的腫瘤驅動基因,被發現在某種類型的胃癌中突變率高達70%-80%。這個基因屬於染色質修飾基因家族成員,通過改變細胞的染色質結構而行使功能。
新研究揭示了胃癌中所有的基因突變,加深了我們對胃癌發展的理解,有助於推動早期診斷技術級實行個體化治療。此外,研究發現的多個腫瘤驅動基因,為胃癌的新藥開發提供了新的靶標,包括ARID1A在內的染色質修飾基因的頻發突變,是通過改變染色質結構以治療胃癌變成可行的療法。
原文鏈接:Exome sequencing identifies frequent mutation of ARID1A in molecular subtypes of gastric cancer