比利時魯汶大學科學家構建了一種基於序列擴增和流式細胞計數技術的新型微生物計數和定量方法。基於這種新的糞便微生物分析定量方法，研究人員能夠更為準確地對不同人類個體的腸道菌群特征進行更為精準地描述。同時，這些新的方法還能幫助研究人員將不同人的腸道菌群與他們自身的腸道差異聯係起來，更加真實地反映人們腸道的微生態。

該研究對應文章名為Quantitative microbiome profiling links gut community variation to microbial load。同樣發表於最新上線的Nature雜誌。

在這項研究之前，大多數基於測序技術的人類糞便樣本腸道微生物分析方法都集中於通過對不同微生物群和代謝途徑的測序分析建立樣本序列文庫。盡管這些方法能夠有效地檢測和揭示與疾病相關的腸道微生物結構變化，但這些方法對腸道微生物與宿主腸道相互作用的反映能力卻十分有限。

同時，對不同腸道菌群的比較分析也不能有效地體現出具體菌群豐度與具體大分子代謝潛力的變化。在不同種微生物數量差別很大的情況下，研究人員很難基於測序比對將微生物的具體特征與諸如代謝物濃度或宿主生理參數等其他重要數據聯係起來。

總體來說，目前大多數對於腸道微生物菌群結構的研究並不能體現出具體微生物數量改變給宿主帶來的影響。這些研究相對忽略了整體微生物豐度變化可能是引起宿主產生疾病的主要原因。

為了解決這些問題，魯汶大學科學家將基於測序技術的微生物分類方法與流式細胞技術相結合，將腸道菌群結構與腸道本身的具體類型相聯係，有效地闡述了腸道微生物豐度變化對腸道菌群結構以及腸道表型的具體影響。

基於這種方法，研究人員通過對克羅恩病患者腸道微生物的定量分析，研究人員避免了腸道微生物相互作用網絡重建中的組成性效應，揭示了克羅恩病腸道微生物組對比分析方法中對類杆菌和普雷沃氏菌的分類折衷並沒能有效地反映病人腸道的真實情況。

基於序列擴增比對和流式細胞計數的結合，研究人員最終確定微生物豐度的改變才是引起克羅恩病患者腸道微生物結構發生改變的根本原因。

原始出處：

Doris Vandeputte，et al.，Quantitative microbiome profiling links gut community variation to microbial load.Nature.15 November 2017.