近日，雲南省第一人民醫院鄭極等發文，旨在應用全基因組表達譜芯片和microRNA芯片檢測人結腸癌細胞DLD1在敲低FOXQ1基因前後mRNA和microRNA的表達改變。研究指出，本研究了解了FOXQ1基因敲低前後mRNA和microRNA的表達改變，為後續FOXQ1在結腸癌的發生發展中的作用機製研究提供了重要的線索和實驗依據。本研究於2016年2月28日在線發表在《世界華人消化雜誌》上。

        本研究抽提兩組細胞的RNA，分別與Whole Human Genome Oligo Microarray(4×44 K, Agilent Technologies)全基因組表達譜芯片和miRCURYTM LNA Array(v.18.0, Agilent Technologies)microRNA芯片進行雜交，應用genespring、genepix軟件對芯片結果進行統計，對全基因組表達譜芯片進行GO、pathway分析，並應用qRT-PCR對部分結果進行驗證。應用Microsoft Excel和SPSS17.0軟件進行統計學分析。

        全基因組表達譜的檢測結果表明，敲低FOXQ1基因後，在芯片所涵蓋的41093個基因中，共有255個基因上調，176個基因下調。qRT-PCR的驗證結果與全基因組表達譜芯片的結果基本相符。MicroRNA芯片的檢測結果表明，敲低FOXQ1基因後，共有31個microRNA上調，12個microRNA下調。