Nature:從功能上對將近4000種BRCA1基因變異體進行分類

作者:佚名 來源:生物穀 日期:18-09-18

        腫瘤抑製基因BRCA1功能缺失能夠導致乳腺癌和卵巢癌。在一項新的研究中,來自美國華盛頓大學的研究人員在功能上對近4000種BRCA1基因變異體進行分類。這些發現可能有助於將癌症風險歸因於未知的BRCA1基因變異體。相關研究結果於2018年9月12日在線發表在Nature期刊上,論文標題為“Accurate classification of BRCA1 variants with saturation genome editing”。

        美國賓夕法尼亞大學腫瘤學家Susan Domcheck(未參與這項研究)表示,“這項研究真的是非凡的傑作。”

        據Nature期刊介紹,數百萬人接受了BRCA測序,但許多BRCA變異體的影響並未被醫生很好地理解。

        通過使用CRISPR,這些研究人員獲得了BRCA1基因的3893種變異體,並將它們整合到經編程後如果非功能性BRCA1存在時就會死亡的單倍體人類細胞係中。這有助於他們觀察哪些序列讓細胞存活,以及哪些序列會殺死這些細胞。已知是良性的或導致腫瘤的BRCA1變異體的研究結果在臨床上與它們的數據存在關聯。

        美國哈佛醫學院的Heidi Rehm認為這些結果“得到了充分驗證”,並提出臨床醫生“應該權衡”針對這些新描述的BRCA1變異體的數據對他們作出的醫療保健建議的影響。

        其他人提出這些數據可能需要在體內進行測試。在針對這項研究作出的評論中,美國國家衛生研究院(NIH)的Stephen Charnock表示,“體外數據獨自不能作為提出醫療建議的基礎---至少要到這種方法在臨床上得到驗證為止。”

        論文共同通信作者、華盛頓大學的Lea Starita指出,“我們希望這個基因變異體數據庫將繼續增加,並將成為指導對可靶向的基因變異體進行解釋的中心點,這是因為它們最初是在女性中觀察到的。”(生物穀 Bioon.com)

參考資料:

Gregory M. Findlay, Riza M. Daza, Beth Martin et al.Accurate classification of BRCA1 variants with saturation genome editing. Nature, Published Online: 12 September 2018, doi:10.1038/s41586-018-0461-z.

Stephen J. Chanock.Gene editing reveals the effect of thousands of variants in a key cancer gene. Nature, Published Online: 12 September 2018, doi:10.1038/d41586-018-06022-y.

關鍵字:BRCA1,基因變異,分類

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