食管鱗狀細胞癌(OSCC)以及腺癌(OAC)是臨床和流行病學特征完全不同的2種癌症。近日研究人員通過對1048例食管腫瘤樣本的研究考察OSCC和OAC之間的基因組特征，生物學和臨床意義。

研究人員對之前的外顯子測序樣品進行重新分析，以識別顯著突變基因(SMG)和突變特征，利用細胞和移植瘤模型研究了新型SMGs的生物學功能，進一步的采取全基因組測序和染色質免疫沉澱(ChIP)分析來描述表觀遺傳學的改變。

研究發現OSCC以及OAC突變驅動基因集存在顯著差異，說明二者屬於獨立的癌變過程。研究統計識別發現了多個新的亞型特異性SMGs、突變特征和預後的生物標誌物。研究首次發現了一個類似於癌症體細胞突變目錄(COSMIC)16的新型突變，對於OSCC的疾病進展極具預測價值，研究發現了2個新的SMGs，分別為CUL3以及ZFP36L2，證實其為口腔鱗癌亞型的重要抑癌基因。進一步的功能喪失機製研究發現，CUL3在OSCC以及其他鱗狀細胞癌中為純合缺失突變，而ZFP36L2與健康食管粘膜的超增強子相關，超高效增強子DNA甲基化可降低鱗狀細胞癌活性組蛋白標記物濃度，提示超增強子與SCC抑製劑的表觀遺傳失活相關。

研究人員對食管鱗狀細胞癌以及腺癌之間的基因組和表觀基因水平差異進行了研究，揭示了食管癌的新分子特征，該研究為食管癌的針對性治療提供了依據。

原始出處：

De-Chen Lin et al.Identification of distinct mutational patterns and new driver genes in oesophageal squamous cell carcinomas and adenocarcinomas.Gut. August 31 2017.