致病菌Ⅲ型分泌係統特有效應蛋白的預測及其特有模體分析醫學論壇網-網聚醫學的力量

　　近期，軍事醫學科學院衛生學環境醫學研究所研究人員發表論文，旨在對病原菌Ⅲ型分泌係統（TTSS）效應蛋白在非致病菌中進行直係同源基因預測，以獲得病原菌Ⅲ型分泌係統特有效應蛋白，並進一步對特有效應蛋白模體構成進行分析，旨在更深入地認識TTSS效應蛋白，為理論研究和生物學實驗提供參考。研究指出，31個致病菌Ⅲ型分泌係統特有效應蛋白序列的獲得，為更精確地在致病性細菌基因組內預測獲得新的效應蛋白序列奠定了基礎；12個效應蛋白特有模體的獲得及其基因本體注釋分析進一步理解了效應蛋白的作用機製。該文發表在2016年第02期《解放軍預防醫學雜誌》上。

　　利用彼此最佳blast方法對效應蛋白在構建的非致病性細菌蛋白質數據庫中進行直係同源基因預測，並利用Inter Pro Scan對預測獲得的特有效應蛋白序列進行模體搜索分析。

　　在49個收集整理的致病菌Ⅲ型分泌係統效應蛋白序列中，有18個效應蛋白在非致病菌中存在直係同源基因，31個效應蛋白（即TTSS特有效應蛋白）在非致病菌中沒有直係同源基因；對31個Ⅲ型分泌係統特有效應蛋白序列進行模體分析，獲得了12個效應蛋白特有模體。