糞便移植的重大貢獻在於其代表了人類微生物組學的首次重要臨床應用。捐獻者接受結腸微生物組變化相關性疾病(如炎症性腸病、糖尿病、代謝綜合征和肥胖)的廣泛篩查;僅2.8%達到標準。捐獻者每周提供3次樣本，並通過49個州和6個縣的醫療結構協議用於治療。樣本通過幹冰遞送。捐獻的糞便可通過口服膠囊、灌腸、內鏡或經鼻胃管等方式應用到位。來自7114例移植者的結果顯示，應答率為86%。盡管糞便移植目前尚處於極早期階段，但有望在其他諸多疾病中具有更廣泛的應用。