加權基因共表達網絡分析揭示了與肺動脈高壓相關的樞紐基因

作者:佚名 來源:MedSci梅斯 日期:23-02-10

        研究背景

        肺動脈高壓(PH)是一種心肺血管疾病,急性危害人類健康,並可能是致命的。它進展迅速,死亡率高。它的病理生理學很複雜,仍未完全闡明;因此,實現治療上的突破很困難。

        研究方法及結果

        在這項研究中,從基因表達總庫(GEO)的GSE24988、GSE113439和GSE117261數據集中提取了58名正常對照組和135名PH患者的數據,並篩選出差異表達的基因(DEGs)。此外,還進行了基因本體論(GO)和京都基因和基因組百科全書(KEGG)的途徑富集分析。加權基因共表達網絡分析(WGCNA)被用來識別與PH相關的關鍵模塊和樞紐基因。確定了八個與PH相關的樞紐基因。此外,還進行了免疫細胞浸潤和樞紐基因之間的相關性分析,接受者操作特征(ROC)曲線顯示,TARDBP具有最佳的診斷功效。

        另外,我們還建立了大鼠缺氧性肺動脈高壓(HPH)模型,並利用Western blotting檢測驗證了樞紐基因在HPH大鼠肺部和肺動脈的表達。我們的結果顯示,mTOR、PSMD2、RBM8A、SMARCA4、TARDBP和UBXN7在肺部高度表達。此外,與對照組相比,EFTUD2、mTOR、RBM8A、SMARCA4、TARDBP和UBXN7在HPH大鼠的肺動脈中明顯上調,而DDB1則明顯下調。

        研究結論:

        總之,我們通過對GEO數據庫的數據進行WGCNA,確定了具有診斷和預測價值的PH中心基因。此外,我們提供了關於PH的新見解,可能被用來評估潛在的生物標誌物基因和治療目標。

關鍵字:肺動脈高壓

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