血漿蛋白質組學聯合單細胞轉錄組學“排序”心梗後心衰標誌物

作者:佚名 來源:MedSci梅斯 日期:20-10-16

心力衰竭(HF)是急性心肌梗死(MI)的最常見的遠期並發症。了解與MI後HF相關的血漿蛋白及其基因表達可能會為發現生物標誌物和藥物靶標確定新的候選對象。

Chan等使用了基於適體的親和力捕獲血漿蛋白質組學,檢測了新西蘭隊列(CDCS [冠心病隊列研究])中MI患者發病後1個月時的1305種血漿蛋白,包括181名MI後隨後因HF住院的患者,與250名MI後中位隨訪4.9年中未發生事件的患者對比。

研究流程

在CDCS隊列中,212種差異性表達的血漿蛋白與隨後的HF事件顯著相關。其中96例與MI後4個月測得的左心室射血分數相關。加權基因共表達網絡分析對212種蛋白質中的63種進行了優先排序,與無事件對照相比,這些蛋白與MI後HF患者之間的相關性明顯更高,而單細胞轉錄組鑒定出15種候選基因蛋白。大多數優先蛋白質是母細胞來源的。

血漿蛋白網絡分析

6種最高度富集的蛋白在三種分析中共有,包括已明確的MI後HF的生物標誌物:B型N端利鈉肽和肌鈣蛋白T,和新興的標誌物,血管生成素-2、血小板反應蛋白-2、潛在轉化生長因子-β結合蛋白-4和卵泡抑素相關蛋白-3。

前6種候選蛋白

總之,大規模人血漿蛋白質組學,在單細胞分辨率下與無偏倚的心髒轉錄組學交叉分析,可為進一步進行MI後HF的機製研究和臨床驗證試驗提供優先考慮的蛋白質候選物。

關鍵字:心梗

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