GIST的病理報告應該規範化，必須全麵準確地注明原發部位、腫瘤的大小、核分裂象計數和腫瘤破裂等情況，並附有免疫組化結果。有條件進行分子檢測的單位，分子檢測結果也應附在病理報告中,是否在病理報告中對GIST 加注危險度，各單位視具體情況而定，從事GIST 靶向治療的臨床醫生應綜合臨床、影像和病理等各方麵的資料進行分析和研判。GIST 病理報告的推薦格式參見下表。