神經母細胞瘤(NB)是兒童中最常見的顱外實體瘤。盡管有多種治療方式,但是高危NB的5年存活率不到50%。最近的研究顯示,與診斷樣本相反,複發性NB腫瘤由於克隆演變而具有更顯著的高突變負擔,這為個性化療法的發展和複發時進行分子分析帶來了挑戰。然而,複發時並不總是可以獲得腫瘤樣本。來自紐約Memorial Sloan Kettering癌症中心的研究人員評估了複發時使用遊離DNA(cfDNA)無創地表征腫瘤譜以鑒定可靶向的遺傳變異體的可行性。
在多種治療期間,研究人員從10例高危4期NB患者中收集了腫瘤標本、血漿和匹配的對照樣品。使用MSK-IMPACT平台分析樣品,該平台采用靶向深度測序法,用於研究410個可操作基因的外顯子和選定的內含子。在診斷、疾病進展或複發期進行的手術中收集腫瘤標本。在疾病進展期收集血漿樣品,收集腫瘤後平均395天(47-1597天)。匹配的對照樣品用於過濾種係變種。
結果顯示,分別從10/10例患者的腫瘤組織和6/10例患者的cfDNA中檢測到體細胞突變和拷貝數變異。這些包括複發性NB的驅動因素,如MYCN擴增和ATRX突變。在4例患者中,cfDNA還檢測到原始腫瘤標本中未檢測到的體細胞突變,包括NRAS、MLL2、CIC和IDH2中的潛在可靶向突變(最近的報道發現它們在複發環境中富集),以及與預後不良相關的ARID1B突變。
本研究表明,通過血漿cfDNA分析對NB的動態遺傳異質性進行無創分析是可行的。這種分析可以潛在地補充腫瘤分析,特別是在複發環境中,用以指導治療計劃。該研究結果要求在臨床試驗中納入cfDNA分析,以進一步評估其對NB患者臨床管理的效果。
整理自ASCO2017年度會議論文集